Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rabgef1Q9JM13 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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Rabgef1Q9JM13 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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Rabgef1Q9JM13 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rabgef1Q9JM13 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Rabgef1Q9JM13 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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