Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Timd2-204ENSMUST00000169584 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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Smg9Q9DB90 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Smg9Q9DB90 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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