Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm23145-201ENSMUST00000178912 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Shmt2Q9CZN7 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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