Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rprd1bQ9CSU0 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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