Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Use1Q9CQ56 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
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