Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Ifi213-201ENSMUST00000097462 2680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Nlrp14-201ENSMUST00000084763 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm15381-201ENSMUST00000121501 1156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cldn16Q925N4 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms