Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm22214-201ENSMUST00000157563 172 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
NipblQ6KCD5 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms