Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Dcx-201ENSMUST00000033642 9074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Olfr613-202ENSMUST00000214173 3840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Pum2-203ENSMUST00000111123 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Vmn1r193-204ENSMUST00000228303 6653 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ecm2Q5FW85 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ecm2Q5FW85 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ecm2Q5FW85 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ecm2Q5FW85 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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