Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr972-201ENSMUST00000079767 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1043-203ENSMUST00000213949 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
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