Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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ptchd1Q14B62 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm13477-201ENSMUST00000121620 2687 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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ptchd1Q14B62 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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ptchd1Q14B62 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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ptchd1Q14B62 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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ptchd1Q14B62 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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ptchd1Q14B62 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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