Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Ccl26-201ENSMUST00000094226 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
VgfQ0VGU4 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms