Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm24931-201ENSMUST00000158324 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Gm3978-201ENSMUST00000163406 2512 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Sh3bp2Q06649 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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Sh3bp2Q06649 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Sh3bp2Q06649 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.2 ms