Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Rpl28P41105 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms