Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PdgfraP26618 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm23463-201ENSMUST00000122468 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm43191-201ENSMUST00000140672 704 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PdgfraP26618 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.1 ms