Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Vmn1r185-209ENSMUST00000228133 5749 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm14957-201ENSMUST00000121069 817 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
NebE9Q1W3 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
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