Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3835-201ENSMUST00000120752 403 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms