Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Mir6960-201ENSMUST00000183449 61 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Spocd1B1ASB6 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms