Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cln8Q9QUK3 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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