Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
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