Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1048-201ENSMUST00000099900 963 ntAPPRIS P2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Olfr1073-ps1-201ENSMUST00000117635 381 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccdc47Q9D024 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms