Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Mrpl20Q9CQL4 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
Mrpl20Q9CQL4 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 2010106E10Rik-202ENSMUST00000113412 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Mrpl20Q9CQL4 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms