Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Use1Q9CQ56 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms