Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Mir301b-201ENSMUST00000102333 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 n-R5s96-201ENSMUST00000082574 124 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm24342-201ENSMUST00000103907 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm3848-202ENSMUST00000151564 301 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Cnot1Q6ZQ08 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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