Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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Trappc1Q5NCF2 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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Trappc1Q5NCF2 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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Trappc1Q5NCF2 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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Trappc1Q5NCF2 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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Trappc1Q5NCF2 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Trappc1Q5NCF2 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Trappc1Q5NCF2 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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Trappc1Q5NCF2 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Trappc1Q5NCF2 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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