Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Clock-204ENSMUST00000202122 5508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Tnik-206ENSMUST00000160518 3996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Gtpbp6Q3U6U5 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32061-201ENSMUST00000207232 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Gtpbp6Q3U6U5 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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Gtpbp6Q3U6U5 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Gtpbp6Q3U6U5 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms