Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Snord92-201ENSMUST00000175548 85 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm12045-201ENSMUST00000122122 573 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Trim71Q1PSW8 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Trbv22-201ENSMUST00000191697 291 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Trim71Q1PSW8 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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