Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm6462-201ENSMUST00000081488 304 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 AC162938.2-205ENSMUST00000217551 2828 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
ptchd1Q14B62 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms