Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Ttc39dQ0VF76 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Ttc39dQ0VF76 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Ttc39dQ0VF76 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Ttc39dQ0VF76 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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Ttc39dQ0VF76 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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Ttc39dQ0VF76 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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Ttc39dQ0VF76 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Ttc39dQ0VF76 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms