Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Defa-ps8-201ENSMUST00000120972 279 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr1327-ps1-201ENSMUST00000117953 835 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm29884-201ENSMUST00000218403 453 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 AC158536.1-201ENSMUST00000222510 256 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PtprmP28828 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PtprmP28828 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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