Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
P20040 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
P20040 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
P20040 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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