Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Nfia-205ENSMUST00000107062 9239 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm7726-201ENSMUST00000206241 231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpraP18052 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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