Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm43705-201ENSMUST00000195958 3717 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 B230206I08Rik-201ENSMUST00000207479 3191 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FxnO35943 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC154738.5-201ENSMUST00000227397 310 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.2 ms