Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ArxO35085 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ArxO35085 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ArxO35085 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ArxO35085 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ArxO35085 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ArxO35085 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ArxO35085 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ArxO35085 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ArxO35085 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Vmn1r72-203ENSMUST00000227010 6279 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ArxO35085 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ArxO35085 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ArxO35085 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms