Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms