Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm44877-201ENSMUST00000206485 274 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm12739-201ENSMUST00000119769 382 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm25606-201ENSMUST00000158363 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 AC125523.1-201ENSMUST00000228018 934 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Grik3B1AS29 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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