Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CtcflA2APF3 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CtcflA2APF3 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CtcflA2APF3 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CtcflA2APF3 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CtcflA2APF3 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CtcflA2APF3 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CtcflA2APF3 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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