Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Cln8Q9QUK3 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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