Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm26404-201ENSMUST00000158498 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Mir6943-201ENSMUST00000185186 66 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Ccr9-204ENSMUST00000168910 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm5938-201ENSMUST00000114030 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Rabgef1Q9JM13 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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