Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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