Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp2aQ9DB34 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms