Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Ccdc39Q9D5Y1 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms