Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm25308-201ENSMUST00000104171 158 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm15689-201ENSMUST00000160604 1159 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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