Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm20268-201ENSMUST00000187932 845 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Sft2d3Q9CSV6 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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