Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm23058-201ENSMUST00000093703 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Olfr381-202ENSMUST00000119863 1065 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm15946-201ENSMUST00000160654 423 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Rprd1bQ9CSU0 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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