Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Mir350-201ENSMUST00000083639 99 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 AC167977.1-201ENSMUST00000221384 234 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Cldn17Q8BXA6 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms