Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc88cQ6VGS5 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3c2g-209ENSMUST00000187618 2023 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
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Ccdc88cQ6VGS5 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Ccdc88cQ6VGS5 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc88cQ6VGS5 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc88cQ6VGS5 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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