Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NipblQ6KCD5 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 AC158805.1-201ENSMUST00000218197 2631 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr1001-ps1-201ENSMUST00000121340 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NipblQ6KCD5 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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