Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Tpm4Q6IRU2 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm8880-201ENSMUST00000121800 454 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Tpm4Q6IRU2 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Tpm4Q6IRU2 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Tpm4Q6IRU2 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Tpm4Q6IRU2 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Tpm4Q6IRU2 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Tpm4Q6IRU2 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Tpm4Q6IRU2 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Tpm4Q6IRU2 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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