Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 AC162931.1-201ENSMUST00000214184 267 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Q3U6N9 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm14751-201ENSMUST00000117693 222 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Q3U6N9 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Anks1b-207ENSMUST00000182045 544 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Q3U6N9 Gm43155-201ENSMUST00000202661 494 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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