Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm8209-201ENSMUST00000206386 553 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Srsf6Q3TWW8 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Srsf6Q3TWW8 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms